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（3）外商投资企业所得税
①检查各项应税收入（收益）的真实性、完整性。一是生产经营收入部分，是否有应计未计产品销售（经营）收入、视同销售是否计入收入。二是财产转让收入、租赁收入、利息收入、特许权使用费、股息收入等是否存在少计收入的情况；国库券利息收入是否多计收入。三是其他收入（包括固定资产盘盈收入、罚款收入、因债权人缘故确实无法支付且两年以上的应付款项、物资／现金的溢余收入、应税的补贴收入、逾期包装物押金、保险无赔款优待、手续费收入等）是否存在少计收入的情况。四是接受捐赠收入是否计入当年应税所得额。五是非货币资产投资收益、对外投资的股权收益及其成本费用的核算是否属实。
②检查税前扣除项目的真实性、合法性、合理性。
第一、是否多列支制造费用、生产成本、产品销售成本，有无多计其他业务成本。
第二、核实交际应酬费、工资福利费、工会经费、职工教育经费、借款利息费用等是否超过法定比例或标准列支；跨行业经营的，是否按适用比例分别计算列支限额。
第三、核实总机构管理费、与生产经营有关的借款利息、工资福利费、财产损失、坏账准备金及其它减值准备等须经税务机关审批后列支的项目。一是有无未经税务机关批准而擅自列支的问题。二是计提金额是否超过规定的列支比例。三是有无应在免税期或减半期列支的损失而在减半期或全额征税期列支从而人为调节应纳所得税额的问题。四是实际发生坏账损失时是否冲减坏账准备；对于超过上一年度计提的坏账准备部分，是否作为当期损失列支；少于上一年度计提的坏账准备部分，是否计入本年度应纳税所得额；已经作为坏账损失在所得税税前扣除的应收账款，在以后年度收回时是否计入当期应纳税所得额。五是存货跌价减值准备、短期投资跌价减值准备、长期投资减值准备、固定资产减值准备、无形资产减值准备、在建工程减值准备、委托贷款减值准备等七项预提准备金是否已经进行纳税调整。
第四、重点检查项目。一是销售提成，有无重复列支供销人员的工资、奖金、差旅费和交际应酬费问题；是否冲减销售收入；是否以“白条”列支。二是技术开发费，是否有技术开发计划和费用预算方案，是否提供政策资料；当年发生的技术开发费是否超过上年实际发生额的10％；有无超范围归集技术开发费套取加成扣除的情况；有无把以前年度未扣除完或不允许扣除的开发费在本年度扣除。三是用于中国境内的对外捐赠，是否属于公益救济性捐赠；是否直接支付给受赠人；有无将摊派支出、赞助支出等作为对外捐赠列支的问题。四是预提费用，是否按照权责发生制提取和列支；除水电费等允许预提的项目外，是否还预提其它费用并税前列支。五是支付给有关部门的管理费，企业支付管理费的主管部门是否为其提供了相关服务；企业支付给主管部门的管理费，是否有规定的收费标准，或者是否符合市场同类服务的收费标准；支付给关联企业的管理费不得列支。六是职工培训费，企业开业前发生的职工培训费，是否未计入企业的开办费；企业为培训职工而购建的固定资产、无形资产等支出，是否直接作为职工培训费进行列支。七是其他项目，如土地（场地）使用费、租金支出、董事会或董事费等。
第五、税前不予列支项目的审核重点。一是资本性支出；二是无形资产受让、开发支出；三是违法经营的罚款和被没收财物的损失、各项税收的罚款、滞纳金；四是自然灾害或意外事故损失有赔偿的部分；五是非公益救济性捐赠；六是各种赞助支出；七是与生产经营无关的支出，如无关担保支出、摊派支出等；八是回扣支出；九是支付给总机构的特许权使用费。
③资产处理。
第一、固定资产折旧、改良。一是确认折旧政策和方法是否与税法规定一致。二是折旧年限是否准确；采用加速折旧法的，是否经过有权税务机关批准；取得已经使用过的固定资产，其尚可使用年限比税法规定短的，如按尚可使用年限计提折旧，是否经过有权税务机关批准。三是计提的起止时间是否正确，有无已经提足折旧继续使用的固定资产仍然提取折旧；新增固定资产计提折旧起始时间是否准确；有无多提或少提折旧；四是对已交付使用但未办理竣工决算的固定资产，是否已暂估入账并按规定计提折旧；正式竣工后，是否及时调整。五是是否按规定残值率提取残值；不留残值的固定资产其原因是否成立。六是固定资产的改良支出，是否一次性税前列支。
第二、无形资产摊销。一是无形资产原值计算是否准确；作为投资或购入的无形资产，其价值是否与合同、协议、验资报告及资产评估结果确认书等证明文件一致。二是摊销年限是否准确；改变摊销政策是否有依据或经税务机关批准。
第三、开办费摊销。一是是否有将不属于开办费的费用计入开办费。二是摊销期限是否低于5年；经营期不满5年按照实际经营期摊销开办费的，是否经主管税务机关批准。三是开办费的摊销是否从投产经营之日起计算。
第四、房屋装修费。一是有无将产权属于本企业的房屋投入使用前的装修费直接计入当期费用；二是核查装修费用的真实性；三是摊销期限的确定、摊销额的计算是否准确。
④税收优惠的检查。
第一、区域性税率优惠和定期减免税优惠的检查。一是企业是否属法定的生产性外商投资企业；二是企业是否位于法定优惠区域；三是享受再减半征收企业所得税待遇的产品出口企业和先进技术企业，是否取得有关部门颁发的证书；先进技术企业再减半征收企业所得税的，其按照税法第八条第一款规定的定期减免税期的最后一年及其次年是否均属于先进技术企业。
第二、生产性外商投资企业兼营非生产性业务的检查。若兼营性外商投资企业投产第一年的生产性业务收入占全部业务收入的比例未超过50％，是否已经享受区域性减低税率优惠；在定期减免税期限（包括先进技术企业和产品出口企业的再减半征收企业所得税期限）内，如果企业生产性业务收入占全部业务收入的比例低于50％，则该年度是否超政策享受减免税待遇。
第三、分别计算定期减免税期限和亏损弥补期限的检查。一是企业由于分期建设分期投产经营、合并、追加投资等原因，导致分别计算定期减免税期限和亏损弥补期限的，其各期的收入、成本费用等核算是否清楚、准确；二是企业分别适用的定期减免税期限是否准确；三是不同税收待遇亏损的弥补是否准确。
第四、特定项目和行业减低税率的检查。一是从事能源、交通、港口码头等特定项目和特定行业建设的企业，其所适用的减低税率优惠是否经过国家税务总局批准；二是从事特定项目和特定行业的企业，经批准适用减低税率的，如果同时兼营其它一般性项目，该一般性项目是否也适用经批准的减低税率优惠。
第五、有分支机构的企业适用所得税税率的检查。一是企业的分支机构适用所得税税率是否准确；二是总机构或者负责汇总纳税的机构本身不从事生产业务的，其所适用的企业所得税税率是否与其生产机构的适用税率一致；三是处在沿海经济开放区、经济技术开发区和高新技术开发区等特定区域内的企业，是否有“区内注册，区外经营”的问题。
第六、定期减免税期间转换的检查。重点检查由免税期进入减半期或由减半期进入全额征税期的企业，期间计算是否准确。
第七、其他税收优惠的检查。检查企业所享受的基础项目投资、特定项目投资、再投资退税、购买国产设备投资抵免企业所得税等税收优惠是否符合规定。
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