五、出口企业遗失出口退税报关单向海关申请补办的，出口企业须在六个月内向海关提出补办申请，逾期海关不予受理。出口企业申请补办须出具主管其出口退税的地（市）国家税务局签发的“关于申请出具（补办报关单）证明的报告”（见附件一）。
六、出口企业将货物报关实际离境出口后，因故发生退运情况，凡海关已签发出口退税报关单的，出口企业须出具主管其出口退税的地（市）国家税务局签发的《出口商品退运已补税证明》（见附件二），海关方能办理退运手续。
七、出口企业开展进料加工业务，必须先持经贸主管部门的批件，送主管其出口退税税务部门审核签章，税务部门须逐笔登记并将复印件留存复查。海关凭盖有主管出口退税税务部门印章的经贸主管部门的批件，方能办理进口料件“登记手册”。出口企业因故未能执行进料加工合同，需持原“登记手册”或海关证明到主管税务部门办理注销手续。
八、海关总署和国家税务总局将启用带有防伪标记的专用出口货物退税报关单。在启用之前，决定自１９９６年３月１５日起，海关所出具的出口退税报关单一律在左上角加贴防伪标签（具体管理办法另行通知）。
九、为防止中途更改或伪造印章等事情发生，决定自１９９６年３月１５日起，对通过海运、铁路运输方式一次出口金额在２０万美元及以上的，及通过公路运输和航空运输等运输方式一次出口金额在１０万美元及以上的出口退税报关单，各税务部门应与海关总署向国家税务总局提供的出口退税报关单电子计算机数据进行核对，对经核对有误的出口退税报关单，主管出口退税的税务部门应派人或发函（挂号信件）联系主管海关再次核对无误后，方可办理退税。
对上述规定限额以下的出口退税报关单经税务部门初步鉴定发现有虚假嫌疑的，也可按以上方法联系主管海关进行核查，方能办理退税。
十、各海关要积极帮助各税务部门鉴别和核对出口退税报关单，要指定专人负责，做好登记工作。主管出口退税的税务部门应持地区（市）级或以上的国家税务局的介绍信到海关核对。海关应及时办理报关单核对事宜，并出具“核对结果证明”（加盖单证专用章，见附件三），免收一切费用。
十一、各海关、税务部门在日常工作中要密切配合，联手打击骗取出口退税活动。海关环节发现为骗取退税而不如实申报的行为由海关按
海关法进行处理，并将有关情况通报税务部门；税务部门在办理退税时发现的骗税行为，由税务部门依法处理，并将情况通报主管海关，海关要将该骗取出口退税的企业作为监控对象进行重点监管。
