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（二）完成了第二次全国畜禽遗传资源调查。我国上一次开展全国性的畜禽遗传资源调查是在上世纪七、八十年代。为摸清资源最新状况，农业部在“十一五”期间组织完成了第二次全国畜禽遗传资源调查。据不完全统计，各地共组织6900多人，投入4500余万元，调查了1200余个畜禽品种（类型），历时5年完成了资源调查和数据分析，掌握了大量第一手资料，摸清了现阶段我国畜禽遗传资源状况。通过调查，发现了槟榔江水牛等86个新资源，对“同名异种”等问题进行了科学界定，品种数量增加300多个。调查中有15个地方畜禽品种资源未发现，超过一半以上的地方品种的群体数量呈下降趋势。在资源调查的基础上，历时两年，编纂完成了《中国畜禽遗传资源志》，志书共分7卷，其中《蜜蜂志》和《特种畜禽志》为国内首次出版。志书系统论述了畜种的起源、演变，品种形成的历史，详细介绍了每个品种的产地分布、外貌特征、生产性能、保护利用状况及展望等，对于产业发展、科学研究、人才培养具有重要的参考价值。
（三）初步建立了以保种场为主、保护区和基因库为辅的畜禽遗传资源保种体系。按照“分级管理、重点保护”的原则，农业部修订并公布了《国家级畜禽遗传资源保护名录》，对138个珍贵、稀有、濒危的畜禽品种实施重点保护。各省（区、市）也相继公布了省级畜禽遗传资源保护名录。“十一五”以来，农业部组织实施了畜禽良种工程、种质资源保护项目等，先后投入3亿多元资金，建设了一批重点畜禽保种场、保护区和基因库。自2006年以来，农业部分两批公布了国家级畜禽保种场109个、保护区22个和基因库6个，江苏、福建等省（区、市）建立了省级畜禽保种场、保护区和基因库，初步建立了以保种场保护区保护为主、基因库保存为辅的畜禽遗传资源保种体系，抢救了一批濒危的畜禽品种，保存了大量珍贵的育种素材。目前，基因库的战略储备作用开始显现，已将延边牛、鲁西牛、新疆黑蜂等品种（类型）的遗传物质返还原产地，特定类型得到了复壮，血统得到了丰富。
（四）畜禽遗传资源的开发利用成效进一步显现。通过对畜禽遗传资源的开发，许多地方品种生产性能有了显著提高，如山麻鸭、绍兴鸭、豁眼鹅等品种的产蛋量世界领先，经选育的辽宁绒山羊产绒量提高近1倍。运用现代育种技术，以地方品种为基本素材，培育了京海黄鸡、夏南牛、巴美肉羊等90个畜禽新品种（配套系）。黄羽肉鸡成功利用矮小基因（dw）育种，实现父母代种鸡节粮15%～20%，黄羽肉鸡出栏占肉鸡出栏总量近50%，长毛兔新品种的产毛性能居国际领先水平，并实现了自我供种。猪、牛和羊地方品种的专门化选育和开发利用已经起步，在一定程度上降低了对国外引进品种的依赖程度，满足了人们对畜产品多样化、优质化、特色化的需求。
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