| 序号 | 规范性文件名称 | 发文编号 | 发布日期 | 清理意见 | 清理理由 |
| 1 | 关于贯彻交通部安全紧急指示和电话会议精神要求制定船舶抗风等级的通知 | 水督字[1963]59号 | 1963年6月3日 | 废止 | 管理理对象性质已改变，管理事项已经不合时宜 |
| 2 | 船舶装载甲板货规定 | 水督字[1964]66号 | 1964年2月27日 | 废止 | 管理要求已散见在现行有关管理规定中 |
| 3 | 关于为在港期租船出具停泊证明的补充通知 | 港监字[1977]65号 | 1977年5月14日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 4 | 关于颁发《海港引航员考试大纲（试行）》的通知 | 港监字[1980]76号 | 1980年12月9日 | 废止 | 上位法《海港引航工作条例》已废止 |
| 5 | 关于颁发和实施《船员服务簿》规定的通知 | 水监字[1984]82号 | 1984年6月27日 | 废止 | 《中华人民共和国船员注册管理办法》（2008年交通部1号令）已有具体管理规定 |
| 6 | 关于救助待命船在港区内使用无线电发信的通知 | 水监字[1984]143号 | 1984年11月5日 | 废止 | 管理方式已不合时宜 |
| 7 | 关于船名音译应统一使用汉语拼音的通知 | 水监字[1985]117号 | 1985年8月14日 | 废止 | 主要管理事项已被新修订发布的《船舶名称管理办法》（海船舶[2004]520号 ）覆盖 |
| 8 | 关于颁发《船员服务簿》实施办法的通知 | 水监字[1985]155号 | 1985年9月28日 | 废止 | 《中华人民共和国船员注册管理办法》（2008年交通部1号令）已有具体管理规定 |
| 9 | 关于《船员服务簿》签发工作若干问题的通知 | 水监字[1986]8号 | 1986年1月22日 | 废止 | 《中华人民共和国船员注册管理办法》（2008年交通部1号令）已有具体管理规定 |
| 10 | 关于颁发《船员档案管理暂行规定》的通知 | 水监字[1988]22号 | 1988年1月20日 | 废止 | 管理事项已被“关于印发《海船船员技术档案管理办法》的通知”（海船员（2006）541号）和“关于印发《内河船员技术档案管理暂行办法》的通知”（海船员[2004]504号）覆盖 |
| 11 | 关于签发《油污损害民事责任保险或其他财务保证证书》有关事项的再补充说明 | 水监字[1988]60号 | 1988年4月4日 | 废止 | 每年度都有新的保险机构公布名单及证书样本。 |
| 12 | 关于劳务外派海员职业培训若干规定的通知 | 港监字[1990]1号 | 1990年1月3日 | 废止 | 管理要求已不合时宜 |
| 13 | 关于在内河船员中进一步开展《船员服务簿》签发工作的通知 | 港监字[1990]53号 | 1990年3月13日 | 废止 | 《中华人民共和国船员注册管理办法》（2008年交通部1号令）已有具体管理规定 |
| 14 | 重申参加航行值班和机舱值班的一般船员办理值班签证的通知 | 港监字[1990]62号 | 1990年3月28日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 15 | 关于未满200总吨航行港澳线船舶的船员免除四项专业训练的批复 | 安监字[1990]100号 | 1990年5月12日 | 废止 | 管理要求已不合时宜 |
| 16 | 关于检查海船船员证书有关问题处理原则的通知 | 安监字[1990]176号 | 1990年8月22日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 17 | 关于《船员服务簿》定期签证问题的复函 | 港监字[1990]222号 | 1990年10月23日 | 废止 | 《中华人民共和国船员注册管理办法》（2008年交通部1号令）已有具体管理规定 |
| 18 | 关于严格掌握滞留运输鲜活、易腐货物船舶的通知 | 港监字[1990]249号 | 1990年12月11日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 19 | 关于国内航线船舶使用统一格式《油类记录簿》的通知 | 安监字[1991]40号 | 1991年2月26日 | 废止 | 管理事项已被“关于启用新版《油类记录簿》的通知”（海船舶[2003]338 ）修订 |
| 20 | 关于天津港监《船舶通过天津新港船闸安全监督管理规定》的批复 | 港监字[1991]165号 | 1991年6月25日 | 废止 | 已重新修订发布“关于天津港监《船舶通过天津新港船闸安全监督管理规定》的批复”（海通航字[1999]347号） |
| 21 | 关于发布《外国籍船舶安全检查试行程序》的通知 | 港监字[1991]216号 | 1991年8月11日 | 废止 | 管理要求已经不合时宜 |
| 22 | 关于实施《成山头水域船舶定线规定（试行）》的批复 | 港监字[1991]232号 | 1991年9月12日 | 废止 | 管理要求已被“关于严格执行成山角水域强制性船舶报告制和成山角水域船舶定线制的通知”（交海发[2001]164）覆盖 |
| 23 | 《内河船舶船员考试发证规则》实施细则 | 港监字[1992]199号 | 1992年9月21日 | 废止 | 所援引的《内河船舶船员考试发证规则》已被《中华人民共和国内河船舶船员适任考试发证规则》（交通部2005年1号令）明令废止 |
| 24 | 关于印发内河事故调查处理有关文书的通知 | 港监字[1993]50号 | 1993年3月22日 | 废止 | 管理事项已被《关于启用内河交通事故调查处理文书标准格式的通知》（海安全[2007]142号）覆盖 |
| 25 | 关于执行交通部1993年第3号令有关问题的通知 | 安监字[1993]206号 | 1993年8月1日 | 废止 | 所援引的原《船舶签证管理规则》已重新修订后废止 |
| 26 | 关于颁布《船舶载运外贸危险货物申报规定》的通知 | 港监字[1993]298号 | 1993年11月8日 | 废止 | 《中华人民共和国船舶载运危险货物安全监督管理规定》（2003年10号令）已有新的管理要求 |
| 27 | 关于加强海船船员适任证书全国统考管理工作若干规定的通知 | 港监字[1994]82号 | 1994年5月4日 | 废止 | 《中华人民共和国海船船员适任考试、评估和发证规则》（2004年交通部6号令）已有具体管理规定 |
| 28 | 关于签发《油污损害民事责任保险或其他财务保证证书》的补充通知 | 港监字[1994]166号 | 1994年8月1日 | 废止 | 油污损害民事责任保险人名单已于2009年重新公布。 |
| 29 | 关于申请授权办理定期签证的通知 | 港监字[1994]265号 | 1994年11月22日 | 废止 | 管理要求已经被新修订的《船舶签证管理规则》覆盖。 |
| 30 | 关于颁布《＜中华人民共和国船舶登记条例〉若干问题说明》的通知 | 港监发[1994]296号 | 1994年12月27日 | 废止 | 管理要求已不合时宜 |
| 31 | 关于实施清理、取缔“三无”船舶通告有关问题的通知 | 港监字[1995]13号 | 1995年1月4日 | 废止 | 规范性文件设定处罚、强制等管理措施 |
| 32 | 关于要求地方船检部门定期上报工作报告的通知 | 船技监字[1995]127号 | 1995年3月6日 | 废止 | 管理事项和要求已经不合时宜 |
| 33 | 关于船舶租赁登记有关问题的批复 | 港监字[1995]100号 | 1995年4月10日 | 废止 | 管理要求已不合时宜 |
| 34 | 关于启用船舶入出境检查单证新格式的通知 | 港监字[1995]175号 | 1995年6月29日 | 废止 | 管理事项和要求已经不合时宜 |
| 35 | 关于船舶登记管理有关问题的通知 | 安监字[1995]189号 | 1995年7月14日 | 废止 | 管理要求已经不合时宜 |
| 36 | 关于颁布办理航程超过20海里或30公里定期签证的规定和授权有关机构办理此定期签证的通知 | 港监字[1995]199号 | 1995年7月19日 | 废止 | 管理要求已经被新修订的《船舶签证管理规则》覆盖。 |
| 37 | 关于全面开展船员培训审验工作的通知 | 港监字[1995]213号 | 1995年7月25日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 38 | 关于救生设备安全检查有关问题的通知 | 安监字[1995]162号 | 1995年9月14日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 39 | 关于试行《中华人民共和国广州港务监督游艇驾驶员培训、发证办法》的通知 | 港监字[1995]309号 | 1995年11月7日 | 废止 | 管理事项被《广东海事局游艇驾驶员适任考试、评估和发证办法》（2006年2月）覆盖 |
| 40 | 关于办理港澳航线船舶登记问题的通知 | 港监字[1996]1号 | 1996年1月13日 | 废止 | 管理要求已不合时宜 |
| 41 | 关于统一张贴“内河船舶救生设备标志”的通知 | 船规字[1996]26号 | 1996年1月17日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 42 | 关于对部分国际航行船舶实施开航前安全检查的通知 | 港监字[1996]89号 | 1996年3月25日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 43 | 关于签发船员培训许可证有关事宜的通知 | 港监字[1996]75号 | 1996年4月5日 | 废止 | 许可事项无上位依据 |
| 44 | 关于民用船舶配备港口、航道图有关事宜的通知 | 港监字[1996]87号 | 1996年4月10日 | 废止 | 管理要求已散见在现行有关管理规定中 |
| 45 | 关于成立外轮图书代售点并加强对外轮的图书供应工作的通知 | 安监字[1996]146号 | 1996年6月24日 | 废止 | 航海图书供应管理方式已变 |
| 46 | 关于磁罗经校正员实操考试有关事项的通知 | 港监字[1996]153号 | 1996年6月26日 | 废止 | 所援引的文件已被“关于颁布实施《中华人民共和国磁罗经校正人员考试发证办法》的通知”（07年284号）明令废止。 |
| 47 | 关于港务（航）监督开展船员培训有关事项的通知 | 安监字[1996]190号 | 1996年8月2日 | 废止 | 管理事项已被《船员培训管理规则》（1997年交通部第13号令覆盖） |
| 48 | 关于禁止为废钢船检验发证的通知 | 船技监字[1996]473号 | 1996年8月7日 | 废止 | 《老旧运输船舶管理规定》（交通部令2006年第8号）已有新的管理要求 |
| 49 | 关于发布《船舶登记监督管理办法（试行）》的通知 | 港监字[1996]284号 | 1996年11月12日 | 废止 | 管理要求已被《船舶登记监督管理办法》（海船舶[2005]317号）修订 |
| 50 | 交通部港口航道图质量监督管理办法 | 安监字[1996]293号 | 1996年12月3日 | 废止 | 管理事项已被《沿海港口、航道测绘产品质量检查验收办法及评定标准》覆盖 |
| 51 | 关于实施《国际安全管理规则》的通告 | 安监局 1997年1月12日 | 1997年1月12日 | 废止 | 管理要求已过管理时效 |
| 52 | 关于内河《船员职务适任证书》和《船员服务簿》采用计算机打印的通知 | 港监字[1997]318号 | 1997年3月15日 | 废止 | 管理要求已不合时宜 |
| 53 | 关于变更船舶登记机关名称和确定船舶登记机关的通知 | 港监字[1997]132号 | 1997年5月19日 | 废止 | 管理要求已经不合时宜 |
| 54 | 地方船检船籍港船舶检验管理暂行办法 | 船技监字[1997]300号 | 1997年5月28日 | 废止 | 管理事项已被《关于印发〈船舶检验工作管理暂行办法〉的通知》（交海发[2000]586号）覆盖 |
| 55 | 直属船检船籍港船舶检验管理暂行办法 | 船技监字[1997]304号 | 1997年5月28日 | 废止 | 管理事项已被《关于印发〈船舶检验工作管理暂行办法〉的通知》（交海发[2000]586号）覆盖 |
| 56 | 关于安全公司管理体系审核中“代表船”审核事的通知 | 安监字[1997]310号 | 1997年9月9日 | 废止 | 主要内容已被重新发布的“《航运公司安全管理体系审核发证规则》和《航运公司安全管理体系审核发证程序》”（海安全字[2001]588号
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