３．改革医疗机构管理体制。各级卫生行政部门是政府依法管理卫生工作的职能部门。要合理划分中央和地方的事权，打破医疗机构行政隶属关系和所有制界限，加强全行业管理。按照转变职能、政事分开的要求，在实施医疗机构分类管理过程中，积极探索建立权责明晰、富有生机的医疗机构组织管理体制，如实行医疗管理委员会、理事会、董事会等管理形式，使其真正成为自主管理的法人实体。
　　医疗机构管理体制改革和对医疗机构实行分类管理是适应社会主义市场经济体制的一项重大改革，有许多开创性的工作要做，涉及面广，政策性强，各地要加强领导，总结经验，稳步推开，保证分类管理工作的平稳实施。
　　由此可见，扩大国有医疗机构的运营自主权，并对其产权进行改革是大势所趋．
　　三、国有医疗机构产权改革后面临的两难选择
　　实践中国有医疗机构产权改革的形式多种多样，但职工出资购买国有资产的一部或全部，从而形成国有资产与职工个人资产的联合或者是全部由职工出资是其主要形式．如上所述，医疗机构分为非营利性的医疗机构和营利性的医疗机构，因此，在产权明晰后，其选择的是非营利性，还是营利性的医疗机构，在法律上会产生两难选择．
　　（一）非营利性医疗机构面临的两难选择
　　非营利性医疗机构是为社会公众利益服务而设立和运营的医疗机构，不以营利为目的．享受相应的税收优惠政策。政府举办的非营利性医疗机构由同级财政给予合理补助．
　　职工个人投资的目的是为了取得收益．但投资的非营利性医疗机构却不以营利为目的，此时职工个人投资收益的目的不能实现．
　　因此，在此存在公益利益与个人利益之间的冲突．面临是保护公众利益还是个人利益的两难选择．
　　（二）营利性医疗机构面临的两难选择
　　营利性医疗机构是指医疗服务所得收益可用于投资者经济回报的医疗机构。以营利为目的．营利性医疗机构医疗服务价格放开，依法自主经营，照章纳税。
　　职工个人投资在营利性医疗机构中其其利益能够得到实现．但要照章纳税．
　　在非营利性医疗机构在医疗服务体系中占主导地位，享受相应的税收优惠政策和财政补助的情况下，营利性医疗机构却照章纳税，在市场竞争中处于不利地位．因不公平的法律地位，造成同是为公众利益服务的医疗机构之间的利益失衡，使个人利益受到损害．因此，面临是特别保护国有资产，还是国有资产与个人资产受同一保护的两难选择．

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